瓜叶菊主要病虫害有白粉病、黄萎病、蚜虫等。
(1)瓜叶菊白粉病。瓜叶菊在幼苗期和开花期如室温高、空气湿度大，叶片上最容易发生白粉病，严重时可侵染叶柄、嫩枝、花蕾等。初发时，叶片出现零星的、不明显的白斑，发展后整个叶片布满灰白色粉状霉层。植株受害后，叶片、嫩梢扭曲萎蔫，生长衰弱，有的完全不能开花。发病严重时。导致叶枯，甚至整株死亡。
防治方法：①室内经常保持良好的通风条件，增加光照，②控制浇水，适当降低空气湿度;③发病后立即摘除病叶，并及时团50%的多茵灵1000倍液，或喷加水800一1000倍的托布津液防止蔓延。
(2)瓜叶菊黄萎病。此病主要由病毒病原菌引起。被害植株分蘖性很强，花序展开受压抑，花色变绿，发育不正常，偶尔亦有花徒长现象。病毒一般由叶蝉传播。
防治方法：①生长期间可适当增施钾肥，以增强植株抗病力，减少病毒侵染的机会;②喷洒0.5%高锰酸钾水溶液进行消毒，可起预防作用;③发现植株染上病毒，应立即拔除病株并烧毁，防止蔓延。
(3)蚜虫。瓜叶菊生长期若通风不好，时常会发生蚜虫危害，虫害严重时喷40%乐果1500-2000倍液进行防治。
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